RNAscope

RNAscope

RNAscope® (新一代RNA原位雜交技術(shù))

RNAscope?專利技術(shù)是美國ACD公司開發(fā)。RNAscope?是一項(xiàng)用于檢測位于完整細(xì)胞中目標(biāo)RNA的定量原位雜交(in situ hybridization , ISH) 的新技術(shù)。該技術(shù)以其能放大特異性信號而非噪音信號的專利探針引物設(shè)計(jì)方法,代表了RNA原位雜交(ISH)領(lǐng)域一項(xiàng)重大進(jìn)步。

  • RNAscope® 探針引物設(shè)計(jì)與信號放大原理

為了能夠顯著提高RNA原位雜交ISH的信號噪聲比,RNAscope?采用了一項(xiàng)原理已被證實(shí)的十分類似于熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)的設(shè)計(jì)原理。兩個獨(dú)立的引物探針 (Z形引物對) 需要隨機(jī)與目標(biāo)序列互補(bǔ)結(jié)合,以實(shí)現(xiàn)信號放大。因?yàn)閮蓚€獨(dú)立引物相互緊挨同時相互互補(bǔ)結(jié)合到一個非目標(biāo)序列的可能性非常之小,這種設(shè)計(jì)原理保障了對目標(biāo)信號的特異性放大。

對于任意一個目標(biāo)RNA序列,都有一組獨(dú)特設(shè)計(jì)的20對Z形引物探針對只針對該目標(biāo)序列具有互補(bǔ)雜交特異性,而不會結(jié)合到非目標(biāo)片段上。

  • RNAscope®引物探針設(shè)計(jì)與信號放大系統(tǒng)的優(yōu)勢

  • 靈敏度:每三對Z形引物對足以實(shí)現(xiàn)對于單一RNA分子的檢測。在部分RNA段落不能被有效抵達(dá)或者RNA部分降解等情況下,20對Z形引物對的設(shè)計(jì)保障了足夠強(qiáng)勁的RNA檢測。
  • 特異性:Z形引物對的設(shè)計(jì)屏蔽了背景噪音。單一的Z形引物探針對于非目標(biāo)序列的結(jié)合不能夠提供信號放大前體序列結(jié)合所需要的足夠長度,以此防止了對于非特異信號的擴(kuò)增,保障了特異性。
  • 單分子量級的可視性與定量分析: 此20x20x20x的引物設(shè)計(jì)與信號放大原理讓單一RNA分子能夠在標(biāo)準(zhǔn)的顯微鏡下以一個點(diǎn)狀信號的方式可視化呈現(xiàn)。
  • 能夠檢測到降解了的RNA: 得益于其相對短小的目標(biāo)結(jié)合區(qū)域(Z形引物對底端40到50個堿基的長度),此Z形引物對的設(shè)計(jì)為檢測到部分降解的RNA提供了保障。
  • RNAscope®技術(shù)的應(yīng)用

  • 藥物開發(fā)和研究應(yīng)用
    靶點(diǎn)選擇和驗(yàn)證
    疾病模型
    臨床前安全性評價
    藥效學(xué)研究
    RNA生物標(biāo)志物開發(fā)和伴隨診斷研究
  • 腫瘤研究的應(yīng)用
    腫瘤異質(zhì)性
    腫瘤微環(huán)境(TME)
    腫瘤干細(xì)胞
    腫瘤標(biāo)記物
    癌基因融合
  • 干細(xì)胞研究
    干細(xì)胞識別和特性分析
    干細(xì)胞功能
    干細(xì)胞信號
    干細(xì)胞與疾病
  • 神經(jīng)生物學(xué)研究
  • 細(xì)胞生物學(xué)研究
  • 傳染病研究
  • 免疫學(xué)研究

實(shí)驗(yàn)方案可在6.5至8小時內(nèi)完成,時間長短取決于不同的RNAscope?實(shí)驗(yàn)方法。手工染色步驟只需要2至2.5小時的操作時間,更快速的完成檢測實(shí)驗(yàn)。